Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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