Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TAF1AQ15573 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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