Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SYCP1Q15431 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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SYCP1Q15431 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYCP1Q15431 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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