Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms