Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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