Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TRAF1Q13077 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRAF1Q13077 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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