Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK2Q13002 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms