Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KCNMA1Q12791 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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KCNMA1Q12791 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KCNMA1Q12791 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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