Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
IFFO1Q0D2I5 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms