Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms