Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPAN4O14817 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TSPAN4O14817 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms