Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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