Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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FOXQ1Q9C009 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXQ1Q9C009 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXQ1Q9C009 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXQ1Q9C009 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXQ1Q9C009 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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