Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms