Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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C1orf140Q5VVS0 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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C1orf140Q5VVS0 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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C1orf140Q5VVS0 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C1orf140Q5VVS0 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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