Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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