Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF239Q16600 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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ZNF239Q16600 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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ZNF239Q16600 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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ZNF239Q16600 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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ZNF239Q16600 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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ZNF239Q16600 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF239Q16600 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF239Q16600 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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