Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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DDB1Q16531 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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