Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NEDD8Q15843 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms