Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL19A1Q14993 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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