Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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RAB39AQ14964 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RAB39AQ14964 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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