Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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ERV3-1Q14264 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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ERV3-1Q14264 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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ERV3-1Q14264 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ERV3-1Q14264 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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