Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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COL9A2Q14055 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
COL9A2Q14055 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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COL9A2Q14055 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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