Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
EIF4EBP1Q13541 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
EIF4EBP1Q13541 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
EIF4EBP1Q13541 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms