Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRPF4BQ13523 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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