Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
XRCC4Q13426 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
XRCC4Q13426 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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