Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SEMA3FQ13275 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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