Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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NR1H3Q13133 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NR1H3Q13133 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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