Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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TRAF1Q13077 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF1Q13077 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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