Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXF2Q12947 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms