Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TTPAP49638 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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TTPAP49638 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TTPAP49638 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TTPAP49638 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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