Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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