Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CTXN3Q4LDR2 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CTXN3Q4LDR2 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms