Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTU2Q2VPK5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms