Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms