Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ECM1Q16610 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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