Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC6Q16204 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC6Q16204 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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