Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHHQ15465 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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