Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NKX1-1Q15270 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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