Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIXQ14938 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms