Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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UBE4AQ14139 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE4AQ14139 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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UBE4AQ14139 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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UBE4AQ14139 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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UBE4AQ14139 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UBE4AQ14139 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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