Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CDH18Q13634 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CDH18Q13634 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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