Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CUL4AQ13619 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CUL4AQ13619 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CUL4AQ13619 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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