Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SP140Q13342 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SP140Q13342 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SP140Q13342 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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