Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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