Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms