Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
STX4Q12846 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
STX4Q12846 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
STX4Q12846 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms