Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRMP28827 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRMP28827 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms