Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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