Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RNF20Q5VTR2 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RNF20Q5VTR2 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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